我国有两亚种:滇西亚种 (t. phayrei shanicus) 分布于云南西部德宏州(盈江、拢川、瑞丽和潞西);滇南亚种 (t. phayrei crepusculus) 分布于云南西南部、南部和中部(临沧、耿马、双江、沧源、西盟、孟连、勐海、景洪、勐腊、绿春、金平、河口、麻栗坡、红河、景东和新平)。
已被列为我国家级 i 类重点保护野生动物。云南有10余个自然保护区(西双版自然保护区、绿春黄连山自然保护区、屏边大围山自然保护区、金平分水岭自然保护区、麻栗坡老君山自然保护区、景东无量山自然保护区、新平哀牢山自然保护区、临沧大雪山自然保护区、沧源南滚河自然保护区、盈江铜壁关自然保护区和高黎贡山自然保护区等)对灰叶猴进行保护。这些保护区多建立于1980-1986年,均为国家级和省级自然保护区,保护区面积约53.6万公顷。自保护区建立后,灰叶猴的栖息生境得到了保护;另外,由于宣传和严格执法,群众保护意识提高,已基本制止了在保护区内外对灰叶猴的偷猎。